Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCG3Q8WXD2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCG3Q8WXD2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms