Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF398Q8TD17 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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