Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BEST4Q8NFU0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BEST4Q8NFU0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms