Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNRF1Q8ND25 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF1Q8ND25 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms