Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HJURPQ8NCD3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms