Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TMEM229BQ8NBD8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM229BQ8NBD8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms