Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms