Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNX29P2Q8IUI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNX29P2Q8IUI4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms