Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU80

TMPRSS6, Transmembrane protease serine 6, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS6Q8IU80 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMPRSS6Q8IU80 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMPRSS6Q8IU80 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms