Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PPP1R42Q7Z4L9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPP1R42Q7Z4L9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPP1R42Q7Z4L9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms