Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00173Q6ZV60 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms