Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCGB1D4Q6XE38 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms