Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPNTQ6UXI9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPNTQ6UXI9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPNTQ6UXI9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPNTQ6UXI9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPNTQ6UXI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms