Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C16orf54Q6UWD8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
C16orf54Q6UWD8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms