Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHL35Q6PF15 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHL35Q6PF15 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms