Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRNP1Q6NT89 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRNP1Q6NT89 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms