Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICL7

SLC35E4, Solute carrier family 35 member E4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E4Q6ICL7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35E4Q6ICL7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35E4Q6ICL7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC35E4Q6ICL7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC35E4Q6ICL7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms