Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCAPH2Q6IBW4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPH2Q6IBW4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NCAPH2Q6IBW4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCAPH2Q6IBW4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCAPH2Q6IBW4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms