Protein–RNA interactions for Protein: Q66K80

RUSC1-AS1, Putative uncharacterized protein RUSC1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1Q66K80 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUSC1-AS1Q66K80 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUSC1-AS1Q66K80 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms