Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALS2CLQ60I27 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms