Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RNF123Q5XPI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RNF123Q5XPI4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms