Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FAM47AQ5JRC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM47AQ5JRC9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM47AQ5JRC9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms