Protein–RNA interactions for Protein: Q50LG9

LRRC24, Leucine-rich repeat-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC24Q50LG9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC24Q50LG9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC24Q50LG9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms