Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG9

DNAL1, Dynein light chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL1Q4LDG9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DNAL1Q4LDG9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAL1Q4LDG9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms