Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC96Q2M329 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC96Q2M329 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC96Q2M329 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms