Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
MSMPQ1L6U9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MSMPQ1L6U9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MSMPQ1L6U9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MSMPQ1L6U9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MSMPQ1L6U9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms