Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IMPG1Q17R60 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IMPG1Q17R60 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
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