Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNRNP35Q16560 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNRNP35Q16560 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNRNP35Q16560 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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