Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCSK7Q16549 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCSK7Q16549 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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