Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PMCHL1Q16048 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PMCHL1Q16048 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms