Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GRK1Q15835 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRK1Q15835 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms