Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCP1Q15431 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYCP1Q15431 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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