Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCM1Q15154 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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PCM1Q15154 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
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PCM1Q15154 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCM1Q15154 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCM1Q15154 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCM1Q15154 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCM1Q15154 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
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