Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BRD3Q15059 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRD3Q15059 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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