Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAPSQ13938 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAPSQ13938 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAPSQ13938 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
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