Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TPBGQ13641 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms