Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NAE1Q13564 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAE1Q13564 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms