Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMED1Q13445 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMED1Q13445 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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