Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT88Q13099 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT88Q13099 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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