Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNG1Q06432 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNG1Q06432 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms