Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EXOSC9Q06265 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
EXOSC9Q06265 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EXOSC9Q06265 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms