Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DEUP1Q05D60 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DEUP1Q05D60 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms