Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRKCDQ05655 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKCDQ05655 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms