Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BDH1Q02338 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BDH1Q02338 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BDH1Q02338 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms