Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CYP27A1Q02318 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CYP27A1Q02318 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CYP27A1Q02318 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms