Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NRG1Q02297 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NRG1Q02297 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms