Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EXOSC10Q01780 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC10Q01780 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms