Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC5Q00444 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms