Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CRB1P82279 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CRB1P82279 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CRB1P82279 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CRB1P82279 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CRB1P82279 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CRB1P82279 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CRB1P82279 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CRB1P82279 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CRB1P82279 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CRB1P82279 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CRB1P82279 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRB1P82279 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRB1P82279 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRB1P82279 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRB1P82279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CRB1P82279 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CRB1P82279 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CRB1P82279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CRB1P82279 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CRB1P82279 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CRB1P82279 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CRB1P82279 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CRB1P82279 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CRB1P82279 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CRB1P82279 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CRB1P82279 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CRB1P82279 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CRB1P82279 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CRB1P82279 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CRB1P82279 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CRB1P82279 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CRB1P82279 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CRB1P82279 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRB1P82279 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRB1P82279 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRB1P82279 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CRB1P82279 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CRB1P82279 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms