Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ELF3P78545 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ELF3P78545 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELF3P78545 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELF3P78545 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELF3P78545 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ELF3P78545 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ELF3P78545 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ELF3P78545 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ELF3P78545 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ELF3P78545 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms